DISCIPLINAS OFERECIDAS

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BIP 5702 ESCRITA CIENTÍFICA (SCIENTIFIC WRITING)

Profs. Resp.:       Drs. Monique Nouailhetas Simon, Agustín Camacho Guerrero, Elisa Maria Costa e Silva de Paiva, Thiago Maia Carneiro, Roberta Pacheco Damasceno, Camilla Alves Santos

Dia da Semana: 4ª feira
Horário:              14h às 16h 
Período:              04/03 a 29/04 
Cancelar até:     18/03

Créditos:             8
Vagas:                 mínimo 8, máximo 27; aceitaremos alunos especiais
Local:                   Centro Didático – IBUSP 

CONTEÚDO: O conteúdo da disciplina é baseado nos capítulos do livro ‘Writing Science’, de Joshua Schimel: 1. Science Writing as Storytelling; 2. Making a Story Sticky; 3. Story Structure; 4. Opening, Funnel and Challenge; 5. Action and Resolution; 6. Internal Structure, Paragraphs and Sentences; 7. Flow and Energizing Writing; 8. Condensing, Editing and Dealing with Limitations.O conteúdo da disciplina é baseado nos capítulos do livro ‘Writing Science’, de Joshua Schimel: 1. Science Writing as Storytelling; 2. Making a Story Sticky; 3. Story Structure; 4. Opening, Funnel and Challenge; 5. Action and Resolution; 6. Internal Structure, Paragraphs and Sentences; 7. Flow and Energizing Writing; 8. Condensing, Editing and Dealing with Limitations

OBS.: Serão oferecidas 27 vagas. Daremos prioridade a pós-graduandos do IB-USP. O objetivo do curso é que cada aluno escreva seu próprio artigo! Pra isso funcionar, é necessário que a estrutura do artigo, pelo menos em termos de ideias, já esteja pronta. É necessário que os dados já estejam todos analisados e a discussão do paper esteja já estruturada. O curso não tem o objetivo de (ou tempo para) discutir desenho experimental, adequação das análises, interpretação de resultados, nem de fazer revisão "do Inglês" dos artigos. Por esse motivo, solicitamos que os alunos interessados pela disciplina enviem um outline do artigo para um dos emails (Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo. ou Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo. Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo.) até o dia 04 de fevereiro de 2020. Um outline descreve a sequência lógica do artigo, com uma frase resumindo a ideia central de cada parágrafo de cada seção do artigo. Não permitiremos a matrícula de alunos que não apresentem o outline ou que apresentem um outline incompleto. Uma breve explicação sobre o quê é um outline e um exemplo concreto estão disponíveis numa pasta google drive acessível a todos pelo link abaixo:

https://drive.google.com/open?id=1PMNeMNt9JysIlkSOz8C2qfrqe_SRJt_o

Toda a disciplina baseia-se na discussão de capítulos do livro ‘Writing Science’, de Joshua Schimel e na produção/crítica/edição de partes do artigo pelos alunos, trabalhando em duplas (companheiros de escrita) e com um dos professores. Dessa maneira, é imprescindível que os alunos matriculados participem de todas as aulas. Desencorajamos fortemente a matrícula de alunos que não possam comparecer a todas as aulas (por exemplo, alunos que tenham trabalhos de campo agendados que coincidam com alguma semana de aula).

Apesar da produção dos textos ser toda em Inglês, as aulas serão todas ministradas em Português (não vai ser necessário falar Inglês na sala de aula).

 

MESTRADO PROFISSIONAL EM ACONSELHAMENTO GENÉTICO E GENÔMICA HUMANA

 

MAG 5004 – GENÉTICA DE POPULAÇÕES E SAÚDE HUMANA (em credenciamento)

Profs. Resp.:        Drs. Diogo Meyer e Michel Satya Naslavsky

Colaboradores:  Drs. Kelly Nunes e Renan Barbosa Lemes

Dia da Semana: 4ª feira                             

Horário:               9h às 13h

Período:               04/03 a 24/06                 

Cancelar até:     

Créditos:              4                                       

Vagas:                 máximo 20

Local:                   Centro Didático – IBUSP 

OBS: Disciplina obrigatória para os alunos do curso de Mestrado Profissional em Aconselhamento Genético e Genômica Humana.

 

CONTEÚDO: Conceitos básicos de genética de populações: frequências alélicas e genotípicas; Mecanismos de manutenção de genes que causam doenças nas populações; Princípios gerais de cálculo de riscos e seu emprego em aconselhamento genético; Detecção de seleção e de outros mecanismos importantes em microevolução em populações humanas; Identificação de genes causadores de doenças monogênicas e multifatoriais.

 

BIOLOGIA (GENÉTICA)

 

BIO 5708 - EXPRESSÃO GÊNICA E FORMAÇÃO DO CORPO EM DROSOPHILA

Prof. Resp.:          Dr. Luiz Paulo Moura Andrioli

Dia da Semana: 3ª feira                             

Horário:              14h às 18h

Período:              28/04 a 30/06

Cancelar até:      13/05

Créditos:              4                                       

Vagas:                 mínimo 3

Local:                   Sala 05 do Centro Didático - IBUSP

 

CONTEÚDO: Artigos científicos e de revisão envolvendo os princípios de biologia do desenvolvimento e a novas técnicas moleculares utilizando a formação do corpo do organismo modelo Drosophila como carro chefe para a discussão desses assuntos.

 

BIO5738 - TENDÊNCIAS ATUAIS EM GENÉTICA E BIOLOGIA EVOLUTIVA

Profs. Resp.:        Drs. Lygia da Veiga Pereira Carramaschi, Tábita Hünemeier e Michel Satya Naslavsky

Dia da Semana: 2ª feira

Horário:              13h às 15h

Período:              23/03 a 08/06

Cancelar até:      09/04

Créditos:              2                                 

Vagas:                  indeterminado

Local:                   Edifício Felix Rawitscher (Minas) - IBUSP

 

CONTEÚDO: Série de aulas expositivas sobre temas amplos, dentro da temática de genética e evolução. As aulas deverão contemplar as metodologias usadas, a motivação para os ensaios e suas implicações teóricas. O curso deverá contar a participação de professores convidados para aulas específicas, sendo estes escolhidos por serem pesquisadores com destaque em sua área de atuação.

 

BIO 5739 - ORGANIZAÇÃO DO CITOPLASMA DA CÉLULA ANIMAL

Prof. Resp.:            Dr. Alberto Augusto Gonçalves de Freitas Castro Ribeiro

Dia da semana:    4ª feira

Horário:                 14h às 18h

Período:                 04/03 a 17/06 (15 semanas)

Cancelar até:         30/03

Créditos:                 8

Vagas:                    mínimo 4, máximo 25

Local:                     Auditório I, Edifício Felix Rawitscher (Minas) - IBUSP

OBS.: Não serão aceitos alunos ouvintes, mas apenas alunos que se matriculem oficialmente como “alunos especiais”, sujeitos a aprovação prévia.

 

CONTEÚDO: 1. A compartimentalização do citoplasma da célula animal: origem e significado. 2. A superfície celular: arquitetura molecular e transporte; junções intercelulares 3. Síntese, transporte e eliminação das secreções celulares. Relações funcionais entre o retículo endoplasmático e o complexo do Golgi. 4.Endocitose e digestão intracelular. 5. O complexo tráfico vesicular intracelular. 6. O papel do peroxissomo na fisiologia celular. 7. Organização funcional da mitocôndria. 8. Citoesqueleto. 9. Bases moleculares dos movimentos celulares.

 

BIO 5752 – BIOESTATÍSTICA

Prof. Resp.:          Dra. Maria Dulcetti Vibranovski

Dia da Semana:  5ª feira                             

Horário:               14h às 18h

Período:                05/03 a 02/07                 

Cancelar até:        03/04

Créditos:               7                                       

Vagas:                  mínimo 5, máximo 10

Local:                    Sala Therezinha Ungaretti, Depto. Genética e Biologia Evolutiva - IBUSP

 

CONTEÚDO: Definições em estatística; Estatística descritiva; Distribuições (Normal, Binomial e Poisson); Teste de Hipótese; Análise de Variância e poder estatístico; Regressão Linear.

 

BIO 5753 – BIOLOGIA CELULAR REDOX: NOVAS FERRAMENTAS E TÉCNICAS QUE IMPULSIONAM NOVAS IDEIAS E ENTENDIMENTOS

Prof. Resp.:            Dr. Luís Eduardo Soares Netto

Colaborador:        Dr. Bruce Morgan (Universität des Saarlandes, Alemanha)

Dia da Semana:    2ª a 6ª feira

Horário:                 9h às 12h e 14h às 18h

Período:                 22/04 a 28/04

Cancelar até:         23/04

Créditos:                 2

Vagas:                     mínimo 10, máximo 40

Local:                      Auditório I, Centro Didático - IBUSP

OBS.: A disciplina será ministrada em inglês.

 

CONTEÚDO:

Lecture topics:

Monday (9:00 – 10:30): An introduction to cellular redox biology

Introduction to electron flow in cellular metabolism. NADH and NADPH as electron carriers. The different cellular roles of NADH and NADPH. Production of reactive oxygen species. Major classes of cellular redox enzymes, i.e. thioredoxins, glutaredoxins, peroxiredoxins and glutathione peroxidases.

Tuesday (9:00 – 10:30): Disulfide bonds in protein folding and protein regulation

Architecture of a disulphide bond. Different functional roles of disulphide bonds, i.e. protein folding/stability and protein regulation. Systems for introducing protein disulphide bonds in bacteria, endoplasmic reticulum and mitochondrial intermembrane space. Formation and reduction of regulatory disulphide bonds.

Wednesday (9:00 – 10:30): Redox Signalling. Regulation of protein oxidation by H2O2

Protein oxidation by H2O2 on cysteine and methionine residues. Thiol pKa and thiol reactivity. Mechanisms to promote thiol reactivity with H2O2: direct oxidation and mediated oxidation. Physiological importance of H2O2 signalling in health, disease and aging.

Thursday (9:00 – 10:30): Genetically encoded probes for H2O2 and glutathione

Introduction to redox sensitive fluorescent proteins. Sensors based on redox relays, i.e. roGFP2-Orp1 and Grx1-roGFP2. Other genetically encoded sensors for H2O2, e.g. HyPer. Mechanism and interpretation of genetically encoded redox probes. Advantages and disadvantages of genetically encoded sensors in comparison to small chemical redox dyes.

Friday (9:00 – 10:30): Genetically encoded probes for NADH and NADPH

Introduction to range of genetically encoded probes for NAD(P)+ and NAD(P)H, i.e. FREX, Peredox, SoNar, iNAPs and Apollo NADP+. Mechanism of these sensors. Application and interpretation of these sensors. Important considerations when using all genetically encoded sensors, i.e. sensitivity, specificity, interaction with other cellular redox species, proteins, small molecules.

Seminars:

Tuesday: (14:00 – 16:00): H2O2 as a signalling molecule. How, when, where, why, what? Seminar and group discussion based on previously assigned reading material.

Thursday (14:00 – 16:00): Application, interpretation and analysis of roGFP2-based genetically encoded redox sensors. Seminar and group discussion based on previously assigned reading material.

Practical Experiments:

Friday (13:00 – 17:00): Monitoring of H2O2 and glutathione sensors in yeast strains

 

BIO 5756 – INTEGRANDO GENÉTICA, SELEÇÃO NATURAL E ECOLOGIA: 40 ANOS DE ESTUDOS COM OS TENTILHÕES DE DARWIN

Prof. Resp.:           Drs. Gabriel Henrique Marroig Zambonato e Monique Nouailhetas Simon

Colaboradores:   Drs. Rosemary e Peter Grant (Universidade de Princeton, EUA)

Dia da Semana:   2ª a 6ª feira

Horário:                9h às 12h e 14h às 18h

Período:                25/05 a 29/05

Cancelar até:        26/05

Créditos:               2

Vagas:                  mínimo 5, máximo 40

Local:                    Sala 03, Edifício Felix Rawitscher (Minas) - IBUSP

OBS.: A disciplina será ministrada em inglês.

 

CONTEÚDO: Como medir valor adaptativo e sua variação; como estimar seleção natural em campo; aspectos ecológicos de seleção natural; estratégias reprodutivas; hibridização entre espécies; especiação, evolução de biodiversidade, isolamento reprodutivo.

 

BIO 5757 – RNAS NÃO CODIFICANTES NO DESENVOLVIMENTO E NA DOENÇA

Prof. Resp.:           Dra. Maria Dulcetti Vibranovski

Colaborador:       Dr. Attilio Pane (UFRJ)

Dia da Semana:   2ª a 6ª feira

Horário:                10h às 12h e 14h às 16h

Período:                04/05 a 08/05

Cancelar até:        05/05

Créditos:                2                                 

Vagas:                   mínimo 5, máximo 15

Local:                     Sala Therezinha Ungaretti, Depto. Genética e Biologia Evolutiva - IBUSP

 

CONTEÚDO: Observações históricas; Dicer e os Argonautas; biogênese do miRNA; miRNAs e regulação de genes; evolução de miRNAs, desenvolvimento e doença; RNA de Interferência (RNAi); A via piRNA, piRNAs em desenvolvimento e doença; A revolução CRISPR / Cas9; RNAs não codificantes e compensação de dosagem; evolução do contexto genômico de miRNAs em seres humanos.

 

BIO 5758 – CRISPR-CAS9: DO DESENHO À ANÁLISE DE EXPERIMENTOS

Prof. Resp.:           Dra. Ana Cristina Victorino Krepischi

Colaborador:       Dr. Tiago Antonio de Oliveira Mendes (Univ. Fed. Viçosa, MG)

Dia da Semana:   2ª e 6ª feira

Horário:                9h às 12h e 14h às 17h

Período:                02/03 a 06/03

Cancelar até:        03/03

Créditos:                2                                 

Vagas:                   mínimo 4, máximo 16

Local:                     Sala 5, Centro Didático e Sala 340 (Lab. Genética Humana), Depto. Genética e Biologia Evolutiva - IBUSP

 

CONTEÚDO: Teoria do sistema CRISPR-Cas9, identificação de alvos e desenho de vetores; digestão de vetor, ligação de gRNA, preparar cultivo para extração de DNA e RNA; transformação bacteriana - extração de DNA e de RNA; real time PCR (quanti-ficação absoluta de cópia de genes); real time PCR (quantificação relativa de expres-são gênica); análise de dados de real time PCR e validação de silenciamento gênico - preparo do cultivo para avaliação de fenótipo; análise de fenótipo após edição gênica.

 

BIO 5760 – ENSINO DE EVOLUCAO EM FACE DOS MOVIMENTOS CRIACIONISTAS

Prof. Resp.:           Dr. Diogo Meyer

Colaborador:       Dra. Eugenie Scott (National Center for Science Education, EUA)

Dia da Semana:   2ª a 6ª feira

Horário:                9h às 12h

Período:                13/04 a 17/04

Cancelar até:        14/04

Créditos:                2                                 

Vagas:                    mínimo 5, máximo 40

Local:                     Sala 5, Centro Didático - IBUSP

OBS.: A disciplina será ministrada em inglês.

 

CONTEÚDO: Pensamento criacionista. História dos movimentos criacionistas nos EUA. O criacionismo e as pseudociências. Relações entre ciência, religião e evolução. Superação de obstáculos do ensino de evolução.

 

MAG 5004 – GENÉTICA DE POPULAÇÕES E SAÚDE HUMANA (em credenciamento)

Profs. Resp.:        Drs. Diogo Meyer e Michel Satya Naslavsky

Colaboradores:  Drs. Kelly Nunes e Renan Barbosa Lemes

Dia da Semana: 4ª feira                             

Horário:               9h às 13h

Período:               04/03 a 24/06                 

Cancelar até:     

Créditos:              4                                       

Vagas:                 máximo 20

Local:                   Centro Didático – IBUSP 

OBS: Disciplina obrigatória para os alunos do curso de Mestrado Profissional em Aconselhamento Genético e Genômica Humana.

 

CONTEÚDO: Conceitos básicos de genética de populações: frequências alélicas e genotípicas; Mecanismos de manutenção de genes que causam doenças nas populações; Princípios gerais de cálculo de riscos e seu emprego em aconselhamento genético; Detecção de seleção e de outros mecanismos importantes em microevolução em populações humanas; Identificação de genes causadores de doenças monogênicas e multifatoriais.

 

BOTÂNICA

 

BIB 5713 – MÉTODOS ANALíTICOS DE SEQUÊNCIAS DE DNA PARA ESTUDOS EM DIVERSIDADE

Profs. Resp.:         Drs. Valéria Cassano e Carlos Frederico Deluque Gurgel (UFSC)

Dia da Semana:   2ª a 6ª feira

Horário:                9h às 16h

Período:               10/02 a 14/02

Cancelar até:       11/02

Créditos:               2

Vagas:                  máximo 25

Local:                    Sala 5, Centro Didático – IB/USP

OBS.: Os alunos devem trazer seus computadores para as aulas práticas.

 

CONTEÚDO: Breve revisão dos princípios de Sistemática e teoria e principais métodos de análise filogenética; pré-análise: cross-capillary (e outros tipos) de contaminação. Algoritmos de alinhamento de DNA, indels, eletroferogramas e contig back-check; concatenação e análise de partição: seleção de modelos, testes de concatenação, congruência, máxima verossimilhança e análise bayesiana de partição; ML e Bayesiana: Teste de hipóteses de topologia, tamanho do conjunto de dados, opções de software e diferenças, web-servidores, burn-in, “dos e dont’s”; bacode de DNA: breve revisão dos princípios e teoria. Delineamento experimental; métodos de código de barras de DNA: Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD), abordagens de máxima verossimilhança e bayesiana para modelos General Mixed Yule Coalescent (GMYC) e Poisson Tree Process approach (PTP); introdução à análise de informações intraespecífica derivada de dados de sequência de DNA: as diferenças entre os processos evolutivos macro e micro, princípios em genética populacional, índices de diversidade genética da população e diferenciação.

 

BIB 5733 – TÓPICOS EM FITOQUÍMICA I

Profs. Resp.:         Dras. Cláudia Maria Furlan e Deborah Yara Alves Cursino Santos

Dia da semana:   4ª feira

Horário:                12h45 às 13h45

Período:                18/03 a 10/06

Cancelar até:        08/04

Créditos:                2

Vagas:                   máximo 15

Local:                    AG da Botânica – IB/USP

 

CONTEÚDO: Temas variados e atuais em estudos fitoquímicos, incluindo metabolismos primário e secundário e suas interfaces; Diversidade e distribuição de metabólitos secundários; Atividades biológicas de metabólitos secundários; Mudanças no perfil de metabólitos secundários frente a fatores de estresse biótico e ambiental; Interação planta-inseto; Metodologias de análise de substâncias secundárias (extração, cromatografias, espectroscopia).

 

BIB 5755 – TÓPICOS EM FICOLOGIA

Profs. Resp.:          Dras. Fanly Fungyi Chow Ho e Mariana Cabral de Oliveira

Dia da Semana:   6ª feira (quinzenal, 10 encontros)

Horário:                12h30 às 13h30

Período:                22/02 a 28/06

Cancelar até:       16/03

Créditos:               2

Vagas:                  máximo 20

Local:                   Centro Didático – IB/USP

OBS: A disciplina será ministrada em INGLÊS, quinzenalmente (10 aulas).

 

CONTEÚDO: Temas diversos e atuais sobre Ficologia e áreas correlatas, incluindo taxonomia e sistemática clássica e molecular, biogeografia e filogenia, ecologia, fisiologia, química, genética, ciências ômicas, maricultura, educação ambiental e aplicações biotecnológicas de algas. A disciplina será baseada em apresentação de seminários e discussões.

 

BIB 5764 – GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS

Profs. Resp.:         Dra. Maria Magdalena Rossi

Colaborador:       Dr. Bruno Silvestre Lira

Dia da Semana:   2ª a 6ª feira

Horário:                9h às 12h

Período:                04/05 a 29/05

Cancelar até:       10/05

Créditos:               8

Vagas:                  mínimo 5, máximo 20

Local:                   Departamento de Botânica - IB/USP

 

CONTEÚDO: A disciplina abordará aspectos teóricos de fisiologia molecular, regulação da expressão gênica, transformação genética de plantas, mutagênese, genômica/epigenômica e engenharia genética e do metabolismo, assim como metodologia específica da área. O conteúdo será apresentado de forma integrada e interdisciplinar desde o ponto de vista da biologia de sistemas visando a compreensão de processo fisiológicos e o melhoramento genético de plantas.

 

ECOLOGIA

 

BIE 5739 - TÉCNICAS BÁSICAS DE ANÁLISE MULTIVARIADA PARA CIÊNCIAS AMBIENTAIS

Prof. Resp.:            Dr. Sérgio Tadeu Meirelles

Dia da Semana:    2ª a 6ª feira

Horário:                 2ª, 4ª e 6ª feiras das 14h às 18h, 3ª e 5ª das 14h às 18h e das 19h às 23h

Período:                 15/06 a 26/07

Cancelar até:        18/06

Créditos:                4

Vagas:                    máximo 16

Local:                      Centro Didático e Sala 358 do Departamento de Ecologia

 

CONTEÚDO: Uso de análise estatística multivariada e sua aplicação em abordagens comuns em ciências ambientais: tipos de dados e propriedades; delineamento e organização do procedimento de análise; estrutura matricial; medidas de distância e similaridade; técnicas de agrupamento; técnicas de ordenação.

 

BIE 5740 – TOPICOS ESPECIAIS EM ECOLOGIA: CONFLITOS E INCERTEZAS NOS ESTUDOS QUE ENVOLVEM NATUREZA, HOMEM E CONSERVACAO

Prof. Resp.:            Dras. Marisa Dantas Bitencourt e Maria Mercedes Montero Bartolomé

Dia da Semana:    2ª a 6ª feira

Horário:                14h às 18h

Período:                27/01 a 10/02

Cancelar até:        30/01

Créditos:                4

Vagas:                    máximo 15

Local:                     Sala 254, Departamento de Ecologia - IB/USP

OBS: 1) Matrículas até 19/12. 2) Período de 27/1 a 4/2, aulas teóricas. Período de 5 a 10/2, atividades práticas e extraclasses.

 

CONTEÚDO: No contexto contemporâneo, caracterizado pelas complexas relações geopolíticas e ecológicas da globalização, percebe-se nitidamente a importância que o contexto social tem nos estudos do meio ambiente. Tanto do âmbito das ciências sociais quanto das ciências naturais, estamos sempre procurando espaços analíticos de encontro para poder entender fenômenos que seriam de difícil compreensão sem um enfoque transdisciplinar. Antes, as ciências sociais e as ciências naturais percebiam a natureza como algo dado e imutável, assento das populações. Desde o início do século XXI sabemos que a natureza é, de certa forma, uma construção sociocultural. Tal construção tem um duplo sentido, preliminarmente por conta das atividades e serviços e posteriormente, por conta das percepções que os distintos agentes sociais têm sobre ela. Assim, podemos nos questionar “O quê é a natureza? O quê é a sociedade humana?” A presente disciplina propõe uma resposta, através da abordagem teórica das Ciências Sociais sobre os meios ecológicos, aproximando os alunos das metodologias de intervenção sócio ecológicas.

 

BIE 5746 - META-ANÁLISE EM ECOLOGIA E EVOLUÇÃO

Prof. Resp.:            Dr. Eduardo da Silva Alves dos Santos

Dia da Semana:   2ª, 4ª e 6ª feira

Horário:                9h às 17h

Período:                25/05 a 05/06

Cancelar até:        28/05

Créditos:                2

Vagas:                   mínimo 5, máximo 20

Local:                    Centro Didático – IB/USP

 

CONTEÚDO: 1. Uma breve história da meta-análise; 2. Meta-análise e outros métodos de síntese; 3. O procedimento meta-analítico; 4. Modelos e métodos; 5. Questões estatísticas e problemas; 6. Apresentação e interpretação dos resultados.

 

BIE 5755 – COMUNICAÇÃO ORAL

Profs. Resp.:         Dr. Marco Antonio Ribeiro de Mello

Dia da Semana: 2ª a 6ª feira

Horário:              9h às 17h

Período:              23/03 a 30/03

Cancelar até:      26/03

Créditos:             4

Vagas:                 máximo 15, sendo 10 regulares e 5 especiais

Local:                   Sala 254, Departamento de Ecologia – IB/USP

OBS: Os alunos devem consultar as informações detalhadas sobre a disciplina no site: https://marcomellolab.wordpress.com/teaching/comunicacaooral/ .

 

CONTEÚDO: Tipos de comunicação científica, o trivium grego, falácias de retórica, discurso de elevador, palestras, mesas-redondas, pôsteres.

 

BIE 5778 – ECOLOGIA DE COMUNIDADES

Profs. Resp.:          Drs. Renata Pardini e Luis César Schiesari

Dia da Semana:   2ª, 4ª e 6ª feira

Horário:                9h30 às 12h30 e 14h30 às 17h30

Período:                27/01 a 21/02/2020

Cancelar até:        04/02/2020

Créditos:               6

Vagas:                  máximo 20

Local:                   Sala 250 do Departamento de Ecologia – IBUSP

 OBS: 1) Matrícula de 4 a 29/11/19, através de formulário específico, na secretaria de pós graduação do IBUSP (ou da unidade USP de origem do aluno). 2) As aulas serão de 27 de janeiro a 17 de fevereiro de 2020. Os dias restantes estão destinados à preparação do ensaio e reunião com os professores. Antes de se inscrever leia atentamente os avisos no site da disciplina: http://ecologia.ib.usp.br/bie5778. 3) Por favor verifique as exigências da disciplina antes de inscrever-se. Ver seção avisos em http://ecologia.ib.usp.br/bie5778.

 

CONTEÚDO: Nesta disciplina discutimos as principais teorias em Ecologia de Comunidades, que propõem como diferentes combinações de quatro processos fundamentais (seleção, dispersão, deriva e especiação) criam e mantém as comunidades biológicas.

 

BIE 5782 – USO DA LINGUAGEM R PARA ANÁLISE DE DADOS ECOLÓGICOS

Prof. Resp.:            Dr. Alexandre Adalardo de Oliveira

Dia da Semana:    2ª, 4ª e 6ª feira

Horário:                 9h às 18h

Período:                 22/04 a 15/05

Cancelar até:         27/04

Créditos:                 4

Vagas:                     mínimo 5, máximo 50

Local:                      Centro Didático - IBUSP

 

CONTEÚDO: 1. Histórico e filosofia de trabalho do R; 2. Funções no R e sua aplicação; 3. Leitura e manipulação de dados; 4. Análise exploratória de dados; 5. Modelos lineares; 6. Simulações e reamostragem. 7. Noções de programação.

BIE 5788 – REDES ECOLÓGICAS

Profs. Resp.:            Drs. Marco Aurélio Ribeiro de Mello e Paulo Roberto Guimarães Junior

Dia da Semana:     2ª a 6ª feira

Horário:                   9h às 17h

Período:                   02/03 a 09/03

Cancelar até:           05/03

Créditos:                  4

Vagas:                     máximo 15, sendo 10 regulares e 5 especiais

Local:                       Sala 254, Departamento de Ecologia - IB/USP

OBS: Os alunos devem consultar as informações detalhadas sobre a disciplina no site: https://marcomellolab.wordpress.com/teaching/redes/

 

CONTEÚDO: Disciplina avançada de análise de dados, focada na ciência de redes e baseada na linguagem de programação R. Conteúdo: Teoria de grafos, teoria de redes, estrutura, dinâmica, curadoria de dados, desenho de redes, análise de redes, interpretação biológica de métricas.

 

BIE 5793 – PRINCÍPIOS DE PLANEJAMENTO E ANÁLISE DE DADOS EM ECOLOGIA

Profs. Resp.:           Drs. Alexandre Adalardo de Oliveira, Adriana Maria Zanforlin Martini, Camila de Toledo Castanho

Dia da Semana:    2ª, 4ª e 6ª feira

Horário:                 8h30 às 17h30

Período:                 02/03 a 01/04

Cancelar até:        10/03

Créditos:                6

Vagas:                   máximo 15

Local:                    Centro Didático - IBUSP

OBS: 1) O curso foi planejado para os alunos ingressantes do mestrado. Por esse motivo esses alunos terão prioridade de matrícula. 2) Não é necessário conhecimentos prévios sobre os assuntos e tampouco conhecimento em programação em linguagem computacional

 

CONTEÚDO: 1. Princípios do planejamento em pesquisa científica; 2. Bases do delineamento experimental/amostral; 3. Instrumentos para a análise exploratória de dados; 4. Teste de hipótese e inferência estatística; 5. Técnicas de Monte Carlo; 6. Conceitos de distribuição probabilística (paramétrica); 7. Modelos lineares simples e múltiplos; 8. Modelos lineares generalizados (Poisson, binomial); 9. Modelos Lineares Mistos e 10. Modelos Lineares Generalizados.

 

FISIOLOGIA GERAL

 

BIF 5703 - ENDOCRINOLOGIA COMPORTAMENTAL

Prof. Resp.:           Dra. Ana Carolina Inhasz Kiss

Colaborador:       Dr. Fernando Ribeiro Gomes

Dia da semana:   2ª a 6ª feira

Horário:                2ª a 4ª: 8 - 12h e 14 - 18h, 5ª: estudo dirigido extra-classe 2h, 6ª: 8 - 12h

Período:                23/03 a 27/03

Cancelar até:       24/03

Créditos:               2

Vagas:                  máximo 20

Local:                    Centro Didático – IB/USP

CONTEÚDO: I. Introdução ao estudo da endocrinologia comportamental e breve histórico; II. Diferenças comportamentais relacionadas ao sexo: diferenciação sexual, comportamento reprodutivo e cuidado parental; III. Interação entre hormônios e o comportamento social; IV. Regulação da ingestão alimentar; V. O papel dos hormônios no estresse; VI. Relação entre hormônios e memória e aprendizagem.

 

BIF 5715 -  FISIOLOGIA CARDIOVASCULAR AVANÇADA

Prof. Resp.:              Dr. José Guilherme de Souza Chauí Mattos Berlinck

Dia da semana:      4ª feira

Horário:                   9h às 12h

Período:                   04/03 a 24/06

Cancelar até:           01/04

Créditos:                  5

Vagas:                     mínimo 6

Local:                       Centro Didático – IB/USP

CONTEÚDO: 1. Revisão do sistema cardiovascular (1). 2. Aspectos relacionados à escala biológica (1), 3. Hidrodinâmica e hidrostática (2). 4. Controle cardiovascular (2). 5. Eletrocardiografia (2). 6. Fisiologia do esforço (2). 7. Modelagem matemática (2). 8. Variabilidade e complexidade do controle cardíaco (2)

 

BIF 5721 – FUNDAMENTOS DE TERMODINÂMICA PARA BIOLOGIA

Prof. Resp.:            Dr. José Guilherme de Souza Chauí Mattos Berlinck

Dia da Semana:   3ª feira

Horário:                14h às 17h

Período:                03/03 a 30/06

Cancelar até:        01/04

Créditos:                5

Vagas:                   mínimo 6

Local:                    Centro Didático – IB/USP

 

CONTEÚDO: 1. Sistemas, Leis e Postulados. 2. Reversibilidade; integrais exatas e não-exatas. 3. Calor - um processo e sua definição mecânica. 4. Entropia e o diferencial exato do calor. 5. Entropia como irreversibilidade. 6. Energia Livre. 7. Ciclos. 8. Sistemas fora de equilíbrio.

 

BIF 5724 – CULTURA DE CÉLULAS IN VITRO DE INVERTEBRADOS MARINHOS

Prof. Resp.:          Dr. Márcio Reis Custódio

Dia da Semana:  3ª e 6ª feira

Horário:                14h às 18h

Período:               10/03 a 27/03

Cancelar até:      15/03

Créditos:              3

Vagas:                 mínimo 2, máximo 6

Local:                   Centro Didático e Sala 300, Depto. Fisiologia – IB/USP

 

CONTEÚDO: 1) Cultura in vitro: Vantagens e desvantagens, ambiente estéril e equipamentos. Estado da arte e problemas encontrados com invertebrados marinhos. 2) Preparo do material: Meios de cultura, salinas, antibióticos e esterilização. 3) Cultura de células: Coleta dos animais, obtenção de células e tecidos. 4) Métodos de cultura: Dissociação mecânica e enzimática, implantes, explantes, esferóides, substratos. 5) Manutenção das culturas: Contagens e expansão. Microbiota e contaminações. 6) Experimentos de curta duração: Métodos, temperatura, pH, suplementação, fatores. 7) Caracterização: Preparo de lâminas, citocentrifugados, fixação e colorações.

 

BIF 5731 – FISIOLOGIA COMPARATIVA DE SISTEMAS         

Prof. Resp.:              Dra. Ana Maria de Lauro Castrucci

Dia da semana:      2ª e 5ª feira

Horário:                   9h às 13h e 14h às 18h

Período:                   06/01 a 06/02/2020

Cancelar até:          14/01/2020

Créditos:                  8

Vagas:                     indeterminadas

Local:                      CBiotec – Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa

OBS: Matrículas somente na Secretaria de Pós-Graduação, até 06/12.

 

CONTEÚDO: 1. Sistema sensorial. 1.1. Processos sensoriais. 1.2. Recepção de sinais químicos. 1.3. Recepção de sinais físicos. 2. Sistemas integradores neurais. 2.1. Neurônios e sinapses. 2.2. Organização e evolução de sistemas nervosos. 3. Sistemas integradores neuroendócrinos. 3.1. Integração neuroendócrina em vertebrados. 3.2. Integração neuroendócrina em invertebrados. 3.3. Relógios biológicos. 4. Sistemas musculares. 4.1. Mecanismos de contração muscular nos vertebrados. 4.2. Sistemas musculares nos invertebrados. 5. Alimento e produção de energia. 5.1. Alimentação. 5.2. Digestão. 5.3. Torpor, hibernação e estivação. 6. Água, Sais e Excreção. 6.1. Fisiologia do balanço hídrico e mineral. 6.2. Rins e excreção. 6.3. Adaptações a ambientes marinhos e desérticos. 7.Oxigênio, dióxido de Carbono e transporte interno de gases. 7.1. Sistemas respiratórios. 7.2. Transporte de gases nos fluidos corporais. 7.3. Sistemas circulatórios. 7.4. Adaptações ao mergulho e a altitude.

 

BIF 5750 – NEUROCIÊNCIA COGNITIVA

Profs. Resp.:         Drs. Gilberto Fernando Xavier, André Frazão Helene e Gustavo Rohenkohl

Dia da Semana:  6ª feira

Horário:               14h às 18h

Período:               17/04 a 26/06

Cancelar até:       04/05

Créditos:               8

Vagas:                  indeterminado

Local:                   Centro Didático – IB/USP

 

CONTEÚDO: 1) Aspectos Históricos e Metodológicos. 2. Mecanismos Biológicos. 3. Sistemas Sensoriais e Percepção I: Fenomenologia. 4. Sistemas Sensoriais e Percepção II: Mecanismos Neurais. 5. Atenção e Probabilidade I: Fenomenologia. 6. Atenção e Probabilidade II: Mecanismos Neurais. 7. Memória e Aprendizagem I: Fenomenologia. 8. Memória e Aprendizagem II: Mecanismos Neurais. 9. Consciência. 10. Prática.

 

BIF 5780 – FISIOLOGIA APLICADA AO CULTIVO DE PEIXES TROPICAIS

Prof. Resp.:           Dra. Renata Guimarães Moreira Whitton

Dia da Semana:   2ª a 5ª feira

Horário:                8h30 às 12h e 14h às 18h

Período:               30/03 a 23/04

Cancelar até:       05/04

Créditos:               8

Vagas:                  mínimo 4

Local:                    Centro Didático – IB/USP

 

CONTEÚDO: 1) Introdução e sistemas de cultivo em piscicultura; 2) Apresentação dos principais mecanismos fisiológicos que regulam e afetam os animais em cultivo; 3) Fisiologia Respiratória: papel dos parâmetros físico-químicos da água na fisiologia respiratória dos peixes teleósteos; 4) Osmorregulação: Conceito de Homeostase; equilíbrio ácido-básico; osmorregulação em teleósteos dulciaquícolas e marinhos e mecanismos de adaptação; 5) Organização do sistema endócrino ligado à reprodução em peixes: eixo hipotálamo – hipófise-gônadas e outros órgãos endócrinos associados; 6) Aplicações do estudo do sistema endócrino na reprodução induzida em peixes: Níveis de intervenção exógena, uso de compostos específicos (trabalho teórico-prático); 7) Processos metabólicos envolvidos na reprodução de teleósteos: mobilização de carboidratos, proteínas e lipídios; 8) Mecanismos de Estresse: Estresse agudo, crônico e respostas fisiológicas; 9) Influência de Agentes estressores na reprodução: qualidade da água, manejo e poluentes; 10) Genética Aplicada à Piscicultura; 11) Aula prática: lâminas de glândulas endócrinas envolvidas na reprodução.

 

ZOOLOGIA

 

BIZ 5704 – ANATOMIA COMPARADA DE PEIXES - UM ENFOQUE EVOLUTIVO

Prof. Resp.:           Drs. Mônica de Toledo Piza Ragazzo e Ralf Britz

Dia da Semana:   2ª a 6ª feira

Horário:                9h às 12h e 14h às 16h

Período:                13/04 a 27/04

Cancelar até:       18/4

Créditos:              6

Vagas:                 máximo 16

Local:                   Centro de Biologia Marinha (CEBIMar), São Sebastião

 

CONTEÚDO: O curso visa familiarizar os alunos com o vasto conhecimento existente sobre anatomia comparada dos peixes e proporcionar o treinamento aos estudos dos diversos complexos anatômicos (esqueleto, musculatura, nervos, principais vasos sanguíneos). A discussão dos complexos anatômicos é feita dentro do contexto da evolução dos vertebrados e aborda conceitos básicos da área, tais como o de homologia. Por esta razão, o curso não é voltado apenas para ictiológos, mas serve de base para todos que se interessem pela área de anatomia comparada de vertebrados. Na primeira parte do curso o enfoque será no estudo de um representante dos Elasmobranchii (tubarões) pois eles preservam um arranjo mais primitivo de alguns complexos anatômicos e na segunda parte o foco é na osteologia de representantes de peixes ósseos (Teleostei).

 

BIZ 5720 – SISTEMÁTICA E EVOLUÇÃO DE ARACHNIDA

Profs. Resp.:          Drs. Pedro Gnaspini Netto, Ricardo Pinto da Rocha, Antonio Domingos Brescovit, e Cristina Anne Rheims

Dias da semana:  2ª a 6ª feira

Horário:                8h às 12h e 13h às 18h

Período:                03/02 a 14/02

Cancelar até:        06/02

Créditos:               4

Vagas:                  máximo 10

Local:                    Centro Didático - IBUSP

                              

CONTEÚDO: Histórico da aracnologia mundial, com destaque para a região Neotropical; Curadoria de Arachnida; Técnicas e protocolos de coleta de aracnídeos; Morfologia externa e da genitália; Utilização de chaves para famílias, gêneros e espécies neotropicais; Evolução de Arachnida; Relacionamento entre as ordens e famílias.

 

BIZ 5737 – COMPORTAMENTO ANIMAL

Prof. Resp.:           Dr. Eduardo da Silva Alves dos Santos

Dia da Semana:  2ª, 4ª e 6ª feira

Horário:               8h30 às 17h30

Período:               27/01 a 14/02

Cancelar até:       01/02

Créditos:              6

Vagas:                  mínimo 5, máximo 16

Local:                   Laboratório Multimídia, Centro Didático - IB/USP

OBS: Matrículas até 19/12.

 

CONTEÚDO: Durante o curso, serão ministradas 11 aulas expositivas sobre os principais temas associados ao estudo de comportamento animal. Cada tema apresentado nas aulas expositivas será acompanhado de uma aula prática (11 no total) na qual os alunos testarão hipóteses utilizando uma abordagem de simulações.

 

BIZ 5790 – CONSERVAÇÃO DA BIODIVERSIDADE MARINHA

Profs. Resp.:         Dr. Antonio Carlos Marques

Colaboradoras:   Dras. Amanda Ferreira da Cunha e Marina de Oliveira Fernandez

Dia da Semana:  2ª a 5ª feira

Horário:               13h30 às 16h30

Período:                03/02 a 01/03

Cancelar até:        09/02

Créditos:               8

Vagas:                  mínimo 4, máximo 10

Local:                    IB/USP

OBS: A disciplina será oferecida nos períodos de 03-06/02; 17-20/02; 13-16/04; 18-21/05.

 

CONTEÚDO: Elementos gerais da conservação da biodiversidade marinha e suas peculiaridades, estimulando o senso crítico para as questões, hipóteses e ferramentas da área. Será apresentado o conhecimento sobre a biodiversidade marinha e seus padrões de distribuição, as causas (históricas e ecológicas) desses padrões, fatores que ameaçam esta biodiversidade e uma visão do estado da arte de acordos e programas em conservação.