DISCIPLINAS OFERECIDAS
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MESTRADO PROFISSIONAL EM ACONSELHAMENTO GENÉTICO E GENÔMICA HUMANA
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MAG 5001 – GENÉTICA HUMANA Profs. Resp.: Dras. Mariz Vainzof e Célia Priszkulnik Koiffmann Profs. Colabs.: Dras. Debora Romeo Bertola e Maria Rita Passos Bueno Dia da Semana: 5ª feira Horário: 9h às 12h Período: 17/08 a 16/11 Cancelar até: 06/09 Créditos: 6 Vagas: máximo 20 Local: Centro Didático e aulas virtuais OBS: Disciplina obrigatória para os alunos do curso de Mestrado Profissional em Aconselhamento Genético e Genômica Humana CONTEÚDO: Herança autossômica e ligada ao X. Herança mitocondrial. Padrões atípicos de herança. Herança multifatorial. Bases moleculares e bioquímicas das doenças genéticas. Cromossomos humanos, alterações cromossômicas numéricas e estruturais. Farmacogenética e Farmacogenômica. Genética e Câncer. Teratogênese. Tratamento das doenças genéticas. Diagnóstico pré-natal. Riscos de ocorrência e de recorrência das doenças genéticas. Estudos populacionais, polimorfismos genéticos e a importância das variantes genéticas benignas e patogênicas.
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MAG 5002 – GENÉTICA MOLECULAR HUMANA E GENÔMICA Profs. Resp.: Drs. Ana Cristina Victorino Krepischi, Maria Rita dos Santos e Passos Bueno, Regina Célia Mingroni Netto e Oswaldo Keith Okamoto Dia da Semana: 6ª feira Horário: 8h às 12h Período: 12/08 a 15/12 Cancelar até: 09/09 Créditos: 8 Vagas: mínimo 5, máximo 25 Local: Centro Didático OBS: Disciplina obrigatória para os alunos do curso de Mestrado Profissional em Aconselhamento Genético e Genômica Humana CONTEÚDO: Estrutura e funcionamento do gene (replicação, transcrição, tradução); mecanismos de regulação da expressão dos genes; organização do genoma humano e suas diferentes categorias de sequências; tipos de variação entre genomas (mutação e polimorfismo) e seu papel na origem das doenças; noções de patologia molecular; técnicas fundamentais de biologia molecular aplicadas ao diagnóstico de doenças genéticas humanas e interpretação de seus resultados; noções básicas sobre utilização de bancos de dados de informações genômicas e sua importância na interpretação de resultados de testes genéticos; sequenciamento de nova geração e sua aplicação no estudo das doenças genéticas humanas.
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MAG 5005 – ASPECTOS ÉTICOS E PSICOLÓGICOS DO ACONSELHAMENTO GENÉTICO Profs. Resp.: Dras. Célia Priszkulnik Koiffmann, Leia Priszkulnik e Mayana Zatz Dia da Semana: 6ª feira Horário: 8h30 às 12h30 Período: 11/08 a 23/11 Cancelar até: 06/09 Créditos: 4 Vagas: máximo 6 Local: Google Meet OBS: Disciplina obrigatória para os alunos do curso de Mestrado Profissional em Aconselhamento Genético e Genômica Humana CONTEÚDO: Discutir aspectos éticos e psicológicos relacionados ao Aconselhamento genético em familias com afetados (ou com risco aumentado de afetados) por doenças genéticas; discutir as repercussões éticas sobre a sociedade dos avanços nas pesquisas genômicas e das pesquisas sobre terapia celular (células-tronco) e terapia gênica.
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BIOLOGIA (GENÉTICA)
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BIO 5723 – TEMAS DE PESQUISA EM GENÉTICA E BIOLOGIA EVOLUTIVA Prof. Resp.: Dra. Lygia da Veiga Pereira Carramaschi Profs. Colabs. Drs. Ana Paula Aprígio Assis e Ernesto da Silveira Goulart Guimarães Dia da Semana: 2ª feira Horário: 13h às 15h Período: a confirmar Cancelar até: a confirmar Créditos: 6 Vagas: máximo 30 Local: Sala Therezinha Ungaretti CONTEÚDO: A disciplina consiste em um ciclo de seminários que abordam projetos, estudos e publicações no contexto de Genética e Biologia Evolutiva, e conteúdos correlatos. Os seminários serão oferecidos por pesquisadores e outros profissionais convidados pela equipe e por docentes do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Biologia Genética). Os estudantes serão convidados a discutir, refletir e emitir comentários sobre os seminários, com o objetivo de fomentar o olhar crítico sobre pesquisas em desenvolvimento na grande área do Programa.
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BIO 5766 – INTRODUÇÃO À MORFOMETRIA GEOMÉTRICA PARA BIOLOGIA Prof. Resp.: Dra. Maria Mercedes Martinez Okumura Dia da Semana: 2ª a 6ª feira Horário: 14h às 17h Período: 24/07 a 28/07 Cancelar até: 25/07 Créditos: 1 Vagas: mínimo 6, máximo 20 Local: Online CONTEÚDO: Análise da forma; Como descrever uma forma; Morfometria geométrica x tradicional; A história da Teoria da Forma; Morfometria em duas e três dimensões; Tipos de marcos; Como obter imagens; Como obter medidas; Forma e tamanho; Tamanho do centroide; Análise Generalizada de Procrustes (GPA); O espaço da forma de Kendall; Como interpretar mudanças de forma; Componentes uniformes e não uniformes da deformação; Análise de Componentes Principais x Relative Warps x Partial Warps; Alometria, Simetria, Modularidade, Filogenia.
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BIO 5769 – CLONAGEM, DESENHO DE INICIADORES E MONTAGEM DE DNA Profs. Resp.: Drs. Luciana Elena de Souza Fraga Machado e Luís Eduardo Soares Netto Colabs.: Thiago Geronimo Pires Alegria Dia da Semana: 2ª a 6ª feira Horário: 8h às 12h e 13h às 17h Período: 21/08 a 25/08 Cancelar até: 22/08 Créditos: 2 Vagas: mínimo 4, máximo 20 Local: Centro Didático CONTEÚDO: 1) Plasmídeos - Entender a estrutura do plasmídeo e as diferentes estratégias npara otimização de expressão de proteínas; 2) Desenho de primers - Desenho de primers manualmente e utilizando programas como NEBuilder; 3) utilização de softwares – Análise das sequências, utilizando os programas Oligo Analyzer da IDT, Expasy translate tool, SnapGene Viewer; 3)PCR e gel de agarose- Amplificação por PCR e análise por gel de agarose; Diagnóstico da ligação inserto-vetor por PCR (D-PCR). 4) DNA-assembly -Montagem do DNA de interesse ao vetor; 5) Transformação em células DH5α de bactéria; 6) Dosagem de DNA no nanodrop; 7) Mini-prep - extração e purificação do DNA do gel, purificação do vetor clivado e do vetor-inserto.
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BIO 5801 – BIOLOGIA EVOLUTIVA E ESTATÍSTICA Prof. Resp.: Dr. Gabriel Henrique Marroig Zambonato Dia da Semana: 5ª feira Horário: 14h às 18h Período: 17/08 a 16/11 Cancelar até: 12/09 Créditos: 6 Vagas: mínimo 2, máximo 20 Local: Centro Didático CONTEÚDO: Origem e manutenção de fenótipos complexos: o mapeamento entre fenótipo e genótipo; arquitetura genética; integração morfológica; adaptação e acaso: modelos nulos e reconstrução de gradientes seletivos.
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MAG 5001 – GENÉTICA HUMANA Profs. Resp.: Dras. Mariz Vainzof e Célia Priszkulnik Koiffmann Profs. Colabs.: Dras. Debora Romeo Bertola e Maria Rita Passos Bueno Dia da Semana: 5ª feira Horário: 9h às 12h Período: 17/08 a 16/11 Cancelar até: 06/09 Créditos: 6 Vagas: máximo 20 Local: Centro Didático e aulas virtuais OBS: Disciplina obrigatória para os alunos do curso de Mestrado Profissional em Aconselhamento Genético e Genômica Humana CONTEÚDO: Herança autossômica e ligada ao X. Herança mitocondrial. Padrões atípicos de herança. Herança multifatorial. Bases moleculares e bioquímicas das doenças genéticas. Cromossomos humanos, alterações cromossômicas numéricas e estruturais. Farmacogenética e Farmacogenômica. Genética e Câncer. Teratogênese. Tratamento das doenças genéticas. Diagnóstico pré-natal. Riscos de ocorrência e de recorrência das doenças genéticas. Estudos populacionais, polimorfismos genéticos e a importância das variantes genéticas benignas e patogênicas.
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MAG 5002 – GENÉTICA MOLECULAR HUMANA E GENÔMICA Profs. Resp.: Drs. Ana Cristina Victorino Krepischi, Maria Rita dos Santos e Passos Bueno, Regina Célia Mingroni Netto e Oswaldo Keith Okamoto Dia da Semana: 6ª feira Horário: 8h às 12h Período: 12/08 a 15/12 Cancelar até: 09/09 Créditos: 8 Vagas: mínimo 5, máximo 25 Local: Centro Didático OBS: Disciplina obrigatória para os alunos do curso de Mestrado Profissional em Aconselhamento Genético e Genômica Humana CONTEÚDO: Estrutura e funcionamento do gene (replicação, transcrição, tradução); mecanismos de regulação da expressão dos genes; organização do genoma humano e suas diferentes categorias de sequências; tipos de variação entre genomas (mutação e polimorfismo) e seu papel na origem das doenças; noções de patologia molecular; técnicas fundamentais de biologia molecular aplicadas ao diagnóstico de doenças genéticas humanas e interpretação de seus resultados; noções básicas sobre utilização de bancos de dados de informações genômicas e sua importância na interpretação de resultados de testes genéticos; sequenciamento de nova geração e sua aplicação no estudo das doenças genéticas humanas.
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MAG 5005 – ASPECTOS ÉTICOS E PSICOLÓGICOS DO ACONSELHAMENTO GENÉTICO Profs. Resp.: Dras. Célia Priszkulnik Koiffmann, Leia Priszkulnik e Mayana Zatz Dia da Semana: 6ª feira Horário: 8h30 às 12h30 Período: 11/08 a 23/11 Cancelar até: 06/09 Créditos: 4 Vagas: máximo 6 Local: Google Meet OBS: Disciplina obrigatória para os alunos do curso de Mestrado Profissional em Aconselhamento Genético e Genômica Humana CONTEÚDO: Discutir aspectos éticos e psicológicos relacionados ao Aconselhamento genético em familias com afetados (ou com risco aumentado de afetados) por doenças genéticas; discutir as repercussões éticas sobre a sociedade dos avanços nas pesquisas genômicas e das pesquisas sobre terapia celular (células-tronco) e terapia gênica.
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BOTÂNICA
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BIB 5701 – TÓPICOS ATUAIS EM FISIOLOGIA VEGETAL Profs. Resp.: Drs. Helenice Mercier e Luciabo Freschi Dia da Semana: 3ª, 4ª e 5ª feira Horário: 14h às 17h Período: 18/09 a 11/10 Cancelar até: 23/09 Créditos: 3 Vagas: mínimo 5, máximo 20 Local: Oferecimento apenas on line CONTEÚDO: Serão abordados temas variados e atuais relativos à área de Fisiologia Vegetal, por meio de palestras apresentadas por pesquisadores convidados, referatas e discussões de artigos publicados em diferentes periódicos científicos.
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BIB 5734 – TÓPICOS EM FITOQUÍMICA II (EM RECREDENCIAMENTO) Profs. Resp.: Drs. Antonio Salatino, Marcelo José Pena Ferreira, Maria Luiza Faria Salatino Dia da semana: 4ª feira Horário: 13h às 14h Período: 02/08 a 18/10 (10 encontros) Cancelar até: a confirmar Créditos: 2 Vagas: mínimo 2, máximo 10 Local: Será oferecida de forma remota (plataforma virtual) OBS.: o calendário de 10 seminários será distribuído na vigência da disciplina. Como o período ultrapassa 10 semanas, em algumas datas não ocorrerão seminários, conforme cronograma a ser definido e distribuído. Disciplina 100% remota, com aulas síncronas através da plataforma virtual Google Meet Interações alunos/professores: durante as aulas e, em outros períodos, por e-mail Controle da frequência: presença na sala virtual da disciplina É necessário que o aluno disponha de equipamento eletrônico (computador ou celular) contendo câmera e áudio (microfone) nas aulas. CONTEÚDO: Temas variados e atuais em estudos fitoquímicos, incluindo o metabolismo primário e secundário e suas interfaces; Diversidade e distribuição de metabólitos secundários; Atividades biológicas de metabólitos secundários; Mudanças no perfil de metabólitos secundários frente a fatores de estresse biótico e ambiental; Interações entre organismos mediadas por metabólitos; Metodologias de análise de metabólitos secundários (extração, cromatografias, espectroscopia, análises metabolômicas).
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BIB 5742 – ESTRUTURA MORFO-ANATÔMICA E MECANISMOS MOLECULARES NO DESENVOLVIMENTO VEGETAL (EM RECREDENCIAMENTO) Profs. Resp.: Dra. Gladys Flavia de Albuquerque Melo de Pinna Prof. Colab.: Dr. Marcelo Carnier Dornelas (UNICAMP) Dia da semana: 2ª a 6ª feira Horário: 9h às 12h e 14h às 17h Período: 04/12 a 15/12 Cancelar até: a confirmar Créditos: 4 Vagas: máximo 20 Local: Centro Didático CONTEÚDO: O curso está estruturado em aulas teóricas, complementadas com discussão de artigos científicos atualizados e aulas práticas de anatomia vegetal, abordando os principais temas descritos abaixo. - Formação do padrão embrionário e suas variações nas plantas vasculares. - Meristema apical radicular: formação e produtos gerados nos diferentes grupos das plantas vasculares. - Desenvolvimento da estrutura primária da raiz: meristemas apicais (protoderme, meristema fundamental e procâmbio); atividade meristemática da endoderme e a expressão gênica a partir de modelos moleculares. - Meristema apical caulinar: formação e estabelecimento dos meristemas apicais. - Sistema caulinar I: desenvolvimento do eixo primário do caule nos diferentes grupos das angiospermas; variações do sistema vascular (tipos de estelo). - Sistema caulinar II: origem e desenvolvimento das folhas; padrões morfo-anatômicos foliares e a expressão gênica a partir de modelos moleculares. - Transição para o florescimento e formação do padrão floral. - Diversidade floral e evolução do sistema ABC.
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BIB 5751 – ESTRUTURAS SECRETORAS EM PLANTAS Profs. Resp.: Dr. Diego Demarco Dia da semana: 2ª a 6ª feira Horário: 8h às 18h Período: 07/08 a 18/08 Cancelar até: 12/08 Créditos: 6 Vagas: máximo 15 Local: Centro Didático CONTEÚDO: Classificação e caracterização das estruturas secretoras em plantas; Ontogênese, estrutura e função; A célula secretora e o processo secretor; Hidatódios, hidropótios e glândulas de sal; Nectários; Coléteres, tricomas glandulares e urticantes; Glândulas de plantas carnívoras; Idioblastos, cavidades e canais secretores; Laticíferos; Glândulas florais: particularidades; Tecidos secretores e a dispersão de sementes; Estruturas secretoras como subsídio para estudos taxonômicos, ecológicos e evolutivos; Fixação e análise histoquímica do exsudato para localização e identificação de classes de metabólitos secundários.
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BIB 5754 – PRODUTOS NATURAIS I: BIOSSÍNTESE E DISTRIBUIÇÃO EM ESPÉCIES VEGETAIS Prof. Resp.: Dr. Marcelo José Pena Ferreira Dia da Semana: 2ª feira Horário: 9h às 11h30 e 14h às 17h30 Período: 31/07 a 04/09 Cancelar até: 10/08 Créditos: 6 Vagas: máximo 15, especiais 3 Local: Centro Didático CONTEÚDO: Biossíntese, distribuição taxonômica e aplicações das principais classes de metabólitos secundários. 1- Ácidos graxos e Policetídeos; 2- Terpenoides; 3- Substâncias fenólicas; 4- Alcaloides e derivados nitrogenados.
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BIB5775 – SISTEMÁTICA DE MACROALGAS MARINHAS COM ÊNFASE NAS ESPÉCIES TROPICAIS DO BRASIL Prof. Resp.: Dra. Valéria Cassano Prof. Colab.: Dr José Marcos de Castro Nunes (UFBA) Dia da Semana: 2ª a 6ª feira Horário: 9h às 12h e 13h30 às 16h30 Período: 23/10 a 06/11 Cancelar até: 26/10 Créditos: 4 Vagas: máximo 30 Local: Centro Didático CONTEÚDO: 1) Introdução à taxonomia de Rhodophyta, Ulvophyceae (Chlorophyta) e Phaeophyceae (Ochrophyta): critérios para definição de gêneros e espécies e categorias taxonômicas superiores; 2) Principais representantes da região tropical da costa brasileira e suas implicações taxonômicas e filogenéticas; 3) Caracterização morfológica e anatômica: organização do talo, estruturas vegetativas, estruturas reprodutivas e históricos de vida; 4) Identificação e caracterização de gêneros e espécies da flora marinha tropical brasileira. Excursão será realizada durante o curso no litoral paulista visando coleta de amostras para fins comparativos entre as floras marinhas tropical e subtropical do país.
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BIB5779 – PRODUTOS NATURAIS II: IDENTIFICAÇÃO EM ESPÉCIES VEGETAIS Prof. Resp.: Dr. Marcelo José Pena Ferreira Dia da Semana: 2ª feira Horário: 9h às 11h30 e 14h às 17h30 Período: 11/09 a 16/10 Cancelar até: 21/09 Créditos: 4 Vagas: máximo 15, especiais 3 Local: Centro Didático OBS.: É altamente recomendável que o aluno tenha cursado a disciplina Produtos naturais I: biossíntese e distribuição em espécies vegetais. CONTEÚDO: Princípios de análise e interpretação de espectros de Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio-1 (RMN 1H) e Carbono-13 (RMN 13C), de Espectroscopia no Ultravioleta (UV) e Infravermelho (IV), e de Espectrometria de Massas (EM). Aplicação desses métodos na identificação das principais classes de metabólitos secundários. Parte prática: Análise de espectros.
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BIB5786 – ELEMENTOS DE TRANSPOSIÇÃO E SEU IMPACTO NOS GENOMAS Prof. Resp.: Dra. Marie Anne Van Sluys Profs. Colabs.: Helba Cirino (Pós-Doc) e Pedro Alexandre Favoretto Galante (Pesquisador Hospital Sírio-Libanês) (A confirmar) Dia da Semana: 4ª feira Horário: 9h às 12h Período: 20/09 a 23/11 Cancelar até: 07/10 Créditos: 4 Vagas: máximo 20 Local: A definir CONTEÚDO: Permitir ao aluno o reconhecimento dos diferentes tipos de elementos de transposição e de suas características, além de introduzir aspectos evolutivos e funcionais relativos a esses elementos genéticos móveis. O curso visa também fornecer subsídios, inclusive de metodologia, para que os alunos possam interpretar criticamente dados recentes nessa área que são publicados em grandes quantidades na literatura. A disciplina abordará em detalhes uma área que não é abordada em nenhuma outra disciplina. Essa é uma área de grande interesse para alunos que queiram se aprofundar em conceitos como estrutura, funcionamento e regulação da expressão gênica dos genomas.
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BIB5793 – ATUALIZAÇÃO FICOLÓGICA II Prof. Resp.: Dras. Estela Maria Plastino e Mariana Cabral de Oliveira Dia da Semana: 6ª feira Horário: 12h30 às 13h30 Período: 11/08 a 01/12 Cancelar até: 04/09 Créditos: 2 Vagas: máximo 20 Local: Centro Didático CONTEÚDO: Temas variados da área de Ficologia. Programa de atualização permanente dos alunos que fazem pós-graduação em algas. Intercâmbio de informações sobre os projetos de pesquisa em Ficologia. Exposição dos projetos de dissertação/tese a debates e críticas mais abrangentes. Curso baseado em seminários.
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ECOLOGIA
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BIE 5705 – ECOLOGIA DE RESERVATÓRIOS Prof. Resp.: Dra. Ana Lúcia Brandimarte Dia da Semana: 3ª feira Horário: 14h às 17h Período: 08/08 a 14/11 Cancelar até: 03/09 Créditos: 6 Vagas: mínimo 5 Local: Centro Didático CONTEÚDO: Histórico da construção de reservatórios. Estruturas físicas das barragens: barragem, vertedouros, comportas, etc. Características morfométricas dos reservatórios: profundidade total, média e relativa; perímetro e índice do desenvolvimento do perímetro; área; volume e índice de desenvolvimento do volume. Importância do tempo de retenção e do tipo de operação sobre a estrutura e funcionamento do reservatório. Estrutura térmica dos reservatórios: comportamento da radiação solar; temperatura e densidade; circulação e estratificação da massa de água. Transporte de nutrientes e sedimento em reservatórios. Zonação de reservatórios: zonas litoral, limnética e profundal; zonas lótica, de transição e lêntica. Comunidades bióticas: fitoplâncton; macrófitas; zooplâncton; zoobentos; peixes. Reservatórios em cascata. Comparação entre reservatórios, lagos e rios: importância do tempo de residência; características físicas; características químicas; comunidades. Impactos da construção de reservatórios: sobre o meio abiótico, a biota aquática e a terrestre (incluindo a população humana). Impactos antropogênicos em reservatórios: eutrofização; assoreamento; contaminação; poluição. Modelagem em reservatórios. Reabilitação de reservatórios impactados.
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BIE 5707 –  INTRODUÇÃO À MODELAGEM HIERÁRQUICA PARA BIÓLOGOS Profs. Resp.: Drs. Glauco Machado, Gonçalo Nuno Côrte Real Ferraz de Oliveira (UFRGS), Marcus Vinícius Vieira (UFRJ) Dia da Semana: 2ª a 6ª feira Horário: 9h às 18h Período: 06/08 a 18/08 Cancelar até: 09/08 Créditos: 4 Vagas: máximo 20 Local: Instituto Alto Montana, Itamonte, MG, de 06 a 13/08 OBS: A disciplina demanda inscrição prévia. Apenas os alunos já selecionados nesta inscrição prévia poderão se matricular. CONTEÚDO: O plano do curso parte da distinção entre trabalho teórico e empírico, aborda a importância da incerteza na ecologia e exemplifica o ajuste de modelos estatísticos a dados sob a perspectiva Bayesiana e de Verossimilhança Máxima. Os exemplos de modelagem usarão dados de contagem de animais não marcados, de marcação e recaptura e de detecção de espécies. No último dia, abordaremos a utilidade da estimativa de parâmetros para o monitoramento e manejo de biodiversidade. Durante as aulas práticas, daremos particular importância à simulação de dados e análise de dados simulados, técnica que permite avaliar o desempenho das análises e compreender o funcionamento dos modelos.
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BIE 5724 – INTRODUÇÃO À ECOLOGIA DO MOVIMENTO E TÉCNICAS DE BIOLOGGING Profs. Resp.: Drs. Francisco Voeroes Dénes e Julia Emi de Faria Oshima Dia da Semana: 2ª a 6ª feira Horário: 9h às 12h e 13h30 às 16h30 Período: 09/10 a 27/10 Cancelar até: 14/10 Créditos: 6 Vagas: máximo 20 Local: Centro Didático CONTEÚDO: Semana 1 - Introdução à Ecologia de Movimento e aplicações - Fundamentos teóricos da Ecologia de Movimento - Uso de biologgers para monitoramento da biodiversidade - Tipos de sensores, fundamentos tecnológicos e limitações - Planejamento para estudos em Ecologia de Movimento: desenvolvimento da pergunta científica, desenho amostral, coleta e análise de dados, aplicação de resultados para conservação Semana 2 - Armazenamento de dados, preparação de dados de rastreamento para análise e extração de variáveis ambientais - Introdução à análise de trajetórias e cálculo de métricas básicas de movimentação - Introdução à análise de uso de área - Introdução à análise de seleção de habitat - Introdução à análise de uso de espaço aéreo.
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BIE 5766 – ECOLOGIA MARINHA Profs. Resp.: Drs. Ronaldo Bastos Francini Filho, Augusto Alberto Valero Flores e Áurea Ciotti Prof. Colab.: Dr. Hudson Tercio Pinheiro Dia da Semana: 2ª a 6ª feira Horário: 9h às 18h Período: 12/12 a 22/12 Cancelar até: 15/12 Créditos: 4 Vagas: máximo 15 Local: Centro de Biologia Marinha da USP (Cebimar-USP, São Sebastião/SP) OBS: Os custos com alojamento e refeição, fornecidos pelo CEBIMar, são de responsabilidade do aluno. Devido às restrições do quadro de funcionários do restaurante do CEBIMar, não será servido o café da manhã nem o almoço aos domingos. Os jantares não serão servidos pelo CEBIMar, ficando também por conta dos alunos. O CEBIMar conta com uma copa comunitária que pode ser utilizada de maneira compartilhada por todos os usuários (alunos, estagiários e pesquisadores) para o preparo de suas refeições. Esta copa está equipada com pia, geladeira, fogão, forno de micro-ondas, e utensílios básicos de cozinha. A utilização desta copa implica, logicamente, na limpeza, imediatamente após o seu uso, de todos os equipamentos e utensílios utilizados para o preparo da comida e para a alimentação, para que outros usuários possam utilizá-los em sequência. Alguns usuários têm preferido fazer refeições em restaurantes da cidade ou encomendado refeições em marmitex, lanches, esfihas e pizzas entregues por motoboys, com recibo emitido mediante pagamento em dinheiro ou cartão. A Administração pode disponibilizar aos alunos uma relação de estabelecimentos que atendem o CEBIMar. Ao efetuarem pedidos para entrega no CEBIMar, favor avisar a vigilância no ramal 628423 ou no celular (12) 99703-6046". CONTEÚDO: (1) História da Ecologia Marinha, (2) Ambiente físico, divisões dos oceanos e principais habitats, (3) Ciclos de vida, dispersão e conectividade ecológica, (4) Estrutura de comunidades no espaço e no tempo: padrões e processos, (5) Abordagens filogenéticas e funcionais (6) Macroecologia marinha, (7) O papel das interações biológicas e do comportamento, (8) Trofodinâmica, (9) Abordagens metodológicas em ecologia marinha, (10) Mudanças globais e impactos antrópicos, (11) Conservação marinha.
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BIE 5798 – BOAS PRÁTICAS E FERRAMENTAS DA CIÊNCIA ABERTA NA ECOLOGIA Profs. Resp.: Drs. Daniela Lopes Scarpa e Gabriel Nakamura de Souza Profa. Colab.: Dra. Melina de Souza Leite Dia da Semana: 2ª a 6ª feira Horário: 9h às 12h e 14h às 17h Período: 07/08 a 11/08 Cancelar até: 08/08 Créditos: 2 Vagas: máximo 15 Local: Departamento de Ecologia ou Centro Didático OBS: Disciplina condensada. O prazo de entrega do trabalho final será de 1 semana após o término das aulas. O aluno deve ter conhecimento da linguagem R e ter, de preferência, dados de seu projeto já coletados ou parcialmente coletados para que possa realizar o trabalho final. As atividades práticas serão feitas no computador, por isso, espera-se que o aluno traga um laptop/notebook. Para casos em que isso não seja possível, por favor escrever para Melina Leite (Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo.). A lista de programas necessários será enviada aos alunos inscritos antes do início do curso. CONTEÚDO: (1) Ciência aberta: Introdução, motivação, tendências e razões para práticas científicas abertas. (2) A importância dos dados em ecologia: valoração, organização e publicação.(3) Reprodutibilidade científica e reprodutibilidade computacional como fundamento básico de qualquer investigação científica. (4) Ferramentas de controle de versão para código de análises de dados (git, GitHub) e ferramentas para escrita de relatórios (material suplementar, websites, livros, vinhetas) e códigos em R (Rmarkdown/Quarto). (5) Outras ferramentas para assegurar reprodutibilidade computacional das análises: dockers/containers, e pacotes em R. (6) Repositórios online e o DOI (Digital Object Identifier): tipos de repositórios para dados, análises e manuscritos (PrePrints). (7) Outras tendências em ecologia e ciência aberta.
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FISIOLOGIA GERAL
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BIF 5720 – OS MÉTODOS EXPERIMENTAL E COMPARATIVO APLICADOS À FISIOLOGIA DE ANIMAIS MARINHOS Prof. Resp.: Dr. Samuel Coelho de Faria Dia da semana: 4ª, 5ª e 6ª feira Horário: 8h às 12h, 14h às 18h e 20h às 22h Período: 22/11 a 24/11 Cancelar até: 24/11 Créditos: 2 Vagas: mínimo 6, máximo 16 Local: CEBIMar/USP - São Sebastião/SP
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BIF 5723 – NEUROFISIOLOGIA DA VISÃO Prof. Resp.: Dr. Gustavo Rohenkohl Dia da semana: 2ª e 4ª feira Horário: 2ª - 9h às 12h, 4ª – 10h às 12h Cancelar até: 05/10 Créditos: 6 Vagas: máximo 10 Local: Centro Didático OBS: Ministrado em Inglês CONTEÚDO: 1. Luz, retina, e o caminho até o córtex 2. Córtex visual primário 3. Cor e movimento 4. Reconhecendo faces e objetos 5. Mecanismos de controle e modulação 6. Sistema óculomotor e visão ativa.
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ZOOLOGIA
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BIZ 5729 – CICLOS DE VIDA E SISTEMÁTICA DE MEDUSAS, COM ÊNFASE EM RHOPALIOPHORA (CNIDARIA) Prof. Resp.: Drs. André Carrara Morandini e Antonio Carlos Marques Prof. Colab.: Dr. Agustin Schiariti (INIDEP-CONICET, Argentina) Dias da semana: 2ª a 6ª feira Horário: 9h às 12h e 13h30 às 16h30 Período: 02/10 a 13/10 Cancelar até: 05/10 Créditos: 4 Vagas: mínimo 2, máximo 10 Local: Centro Didático - IB , na semana de 02-06/10, e CEBIMar (Centro de Biologia Marinha da USP, São Sebastião-SP), na semana de 09-13/10 CONTEÚDO: Sistemática, evolução, biologia e ecologia de águas-vivas com ênfase em espécies da América do Sul.
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BIZ 5765 – EMBRIOLOGIA COMPARATIVA DE INVERTEBRADOS MARINHOS COMPARATIVE EMBRYOLOGY OF MARINE INVERTEBRATES (CEMI) Prof. Resp.: Drs. Àlvaro Esteves Migotto (CEBIMar), André Carrara Morandini (CEBIMar, Zoologia IB) e Federico David Brown Almeida (Zoologia IB) Profs. Colabs.: Drs. Augusto Alberto Valero Flores (CEBIMar) Kristen Koening (Harvard), Sônia Cristina da Silva Andrade (Genética IB), Vinicius Queiroz Araújo (Fisiologia IB) Dias da semana: 2ª a sábado Horário: 8h às 22h Período: 05/08 a 20/08 Cancelar até: 10/08 Créditos: 6 Vagas: máximo 20 Local: CEBIMar/USP São Sebastião/SP OBS: Ministrado em Inglês CONTEÚDO: Os professores ministrarão palestras sobre reprodução, ciclos de vida e biologia geral dos diferentes filos de Metazoa em um contexto evolutivo, com ênfase no desenvolvimento embrionário e larval. Serão realizadas saídas de campo, durante períodos de maré baixa ou por mergulhos (opcionais), para coleta de espécimes que serão utilizados nas aulas práticas gerais e para estudos específicos (acompanhamento do desenvolvimento de uma ou mais espécies) a serem conduzidos por cada aluno. Larvas serão coletadas no plâncton e/ou serão realizadas fertilizações in vitro de diferentes espécies para a obtenção de embriões e larvas, os quais serão mantidos em cultivo pelos estudantes. O desenvolvimento dos animais em cultura será registrado por meio de desenhos, fotos e vídeos que serão apresentados ao final do curso. As aulas práticas incluirão também técnicas de trabalho para estudos celulares, fisiológicos, de morfologia funcional, e ecológicos de embriões e larvas. Artigos da literatura primária serão discutidos no curso. Ao final da disciplina, os alunos deverão apresentar os resultados e conclusões a respeito de suas observações pessoais sobre a(s) espécie(s) escolhida(s). Course instructors will give lectures on reproduction, life cycles and general biology of the different phyla of Metazoa in an evolutionary context, with an emphasis on embryonic and larval development. Field trips will be carried out, during periods of low tide or by diving (optional), to collect specimens that will be used in general practical classes and for specific studies (monitoring the development of one or more species) to be conducted by each student. Larvae will be collected from the plankton and/or in vitro fertilization of different species will be performed to obtain embryos and larvae, which will be kept in culture by the students. The development of animals in culture will be recorded through drawings, photos and videos that will be presented at the end of the course. Practical classes will also include working techniques for cellular, physiological, functional morphology, and ecological studies of embryos and larvae. Primary literature articles will be discussed in the course. At the end of the course, students must present the results and conclusions regarding their personal observations about the chosen species(s).
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BIZ 5774 – PRINCÍPIOS DE EVOLUÇÃO MOLECULAR APLICADOS À RECONSTRUÇÃO FILOGENÉTICA Profs. Resp.: Dr. Daniel José Galafasse Lahr Dia da Semana: 2ª a 6ª feira Horário: 13h às 17h Período: 11/09 a 28/09 Cancelar até: 17/09 Créditos: 4 Vagas: máximo 10 Local: Centro Didático CONTEÚDO: Esta é uma disciplina introdutória que visa dar um amplo entendimento dos conceitos envolvidos na reconstrução histórica a partir de dados moleculares. A disciplina é teórica e enfatizará a descoberta e compreensão de temas fundamentais para estudos filogenéticos moleculares. Existe adicionalmente um forte enfoque no desenvolvimento das habilidades: leitura, escrita, apresentação oral e discussão acadêmica. Ao final da disciplina, é esperado que os alunos tenham: 1. produzido numerosos textos curtos de qualidade, 2. realizado pelo menos uma apresentação oral no formato de apresentações em conferências, 3. realizado a leitura e discussão cuidadosa de textos essenciais na área. A disciplina aborda temas teóricos fundamentais de evolução molecular para sua aplicação em reconstruções históricas. A evolução molecular é disciplina desenvolvida ao longo de décadas e que possui um arcabouço de conceitos e ideias que não são necessariamente bem difundidos entre aqueles que aplicam seus métodos com o objetivo de criar reconstruções filogenéticas, e por consequência classificações e inferências evolutivas. Esta disciplina busca fornecer um fundamento introdutório para estudantes do programa de PG Zoo, e outros programas relacionados. A disciplina é indicada para estudantes que tenham pouca familiaridade com evolução molecular, porém com conhecimento sobre sistemática filogenética. É indicada também àqueles estudantes cujos projetos não envolvem filogenias moleculares, porém querem ter conhecimento acadêmico sobre o assunto para facilitar a leitura e diálogo com esta disciplina fundamental. A disciplina é teórica e não enfatizará métodos de reconstrução, nem treinará a utilização de softwares específicos.
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